Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms