Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RRM1P23921 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RRM1P23921 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms