Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFX1P22670 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFX1P22670 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFX1P22670 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFX1P22670 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms