Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms