Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NELFEP18615 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NELFEP18615 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms