Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms