Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOP08100 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOP08100 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOP08100 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOP08100 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOP08100 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOP08100 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms