Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F13BP05160 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F13BP05160 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13BP05160 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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