Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms