Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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