Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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