Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms