Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms