Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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