Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms