Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms