Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms