Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HHLA1C9JL84 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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