Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms