Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms