Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms