Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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