Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX2IPQ9Y2D8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms