Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMG5Q9UPR3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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