Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK1NQ9UHG2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms