Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNTNAP2Q9UHC6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms