Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms