Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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