Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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COL20A1Q9P218 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL20A1Q9P218 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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