Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD3Q9P035 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms