Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms