Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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