Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms