Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BBS2Q9BXC9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms