Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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