Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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