Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms