Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms