Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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