Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms