Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms