Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF548Q8NEK5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF548Q8NEK5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF548Q8NEK5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF548Q8NEK5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF548Q8NEK5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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