Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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