Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms