Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL3Q8IVW4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms