Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms