Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms