Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC24A5Q71RS6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms