Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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