Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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